Siendo director coral y composidor Jan Míšek adquirió experiencia valiosa. Realizó muchos cursos con los expertos como Prof. Gert Frischmuth, Prof. Friedrich Krell, Prof. Jerry Jordan y participó en muchos talleres ofrecidos por Prof. Helmuth Rilling en la Bachakademie Stuttgart.

Al formar su primer coro en 1993 fue nombrado er director del coro de cámara Kantiléna y estableció el coro masculino Hradec Králové. Al continuación realizó su sueño y estableció en 1999 el coro de niños BONIFANTES en Pardubice. A pesar de su juventud ya obtuvo premios numerosos para su presentaciones excelentes como director coral. Jan Míšek y sus coros ganaron muchas medallas de oro.

Sr. Míšek colaboró como director invitado con muchas orquestas (Orquesta Filarmónica de Cámara de Pardubice, Orquesta Filarmónica Hradec Králové, Orquesta Filarmónica del conservatorio de Praga y Pardubice, Barroco sempre giovane y muchas otras). Además trabajó con estrellas de la ópera como Mara Zampieri, Peter Dvorský o José Carreras.

Jan Míšek es también un composidor muy activo. Como composidor visitó la Internationale Sommermusikakademie (academia internacional musical de verano) en Michelstadt con Prof. Jan Jirásek y Prof. Ofer Ben-Amots. Ganó el segundo premio en el concurso internacional de composición de Joseph Dorman. En 2003 fue premiado por la asociación de los coros checos con el premio “Junior director coral”. Los expertos aprecian mucho sus cualidades como interpretador de la música del siglo XX (por ejemplo Shostakóvich: sinfoniía número. 13 "Babij Jar", Rutter: Gloria) y como interpretador históricamente auténtico de la música barroca (por ejemplo Händel: Judas Maccabaeus, Bach: Pasión de San Mateo).